细胞和分子生物学中心(CCMB)的研究人员开发了一种新的低成本和低技术要求的SARS-CoV-2测试所需的测试，称为反转录巢式PCR(RT-nPCR)测试。

此测试不需要实时定量RT-qPCR。CCMB研究团队开发的RT-nPCR已显示出与标准RT-qPCR测试相当的性能。嵌套式PCR(RT-nPCR)方法不依赖于RT-qPCR，而是使用标准RT-PCR作为终点分析的一部分。

在比较这两种测试结果的过程中，研究人员发现标准的RT-qPCR测试在真实的测试场景中检测效率可能较低(低于50%)，这可能是由于许多样品中的病毒代表性较低。这一发现带动了直接在测试环境中监视检测效率的重要性。

“我们开发并测试了一种RT-nPCR方案，该方案包括用于扩增四个SARS-CoV-2扩增子和对照人扩增子的多重初级RT-PCR，然后是用于单个扩增子的次级巢式PCR。我们还检查了RT-nPCR在合并检测中和在不分离RNA的情况下直接扩增中的用途。” CCMB主任Rakesh Mishra说。

使用RT-nPCR检查从鼻咽拭子样本中分离的RNA，该样本先前已使用两种RT-qPCR测试之一进行了测试，并比较了结果。发现将两个标准RT-qPCR测试结合在一起，RT-nPCR测试能够通过RT-qPCR将90%的检测样品鉴定为阳性。

在标准RT-qPCR测试阴性的样本中，它还检测出13%的样本为阳性(可能是假阴性)。根据这项研究中通过RT-nPCR测试通过实验测得的假阴性率，据估计，在实际测试场景中，多达50%的阳性样品在RT-qPCR的单次通过测试中可能逃脱了检测。

一份声明说，印度医学研究理事会(ICMR)仅推荐将逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测用于新型检测。

“这项新测试正在等待ICMR的批准。我们可能会要求ICMR在没有RT-qPCR机的地方使用该测试。” Mishra说。